常见引起肾萎缩的原因有多种，其中慢性肾小球肾炎是较为常见的原因之一，据统计，约有一定比例的慢性肾小球肾炎患者后期会出现肾萎缩情况。
一、慢性肾脏疾病相关原因
原发性肾小球疾病：像慢性肾小球肾炎，它会逐渐破坏肾小球结构，影响肾脏正常功能，长期发展就可能导致肾萎缩。患者往往会有蛋白尿、血尿等表现，若不及时控制病情，肾萎缩会逐步加重。继发性肾脏疾病：比如糖尿病肾病，糖尿病患者若血糖控制不佳，病程较长时，高血糖会损伤肾脏血管和肾小球，引发肾脏病变，最终导致肾萎缩。还有高血压肾损害，长期高血压会使肾脏小动脉硬化，肾实质缺血，进而出现肾萎缩，患者通常有长期高血压病史。
二、血管性疾病导致
肾动脉狭窄：肾动脉狭窄会使肾脏血液灌注不足，肾脏长期处于缺血状态，就会影响其正常结构和功能，慢慢导致肾萎缩。肾动脉狭窄可能是动脉粥样硬化引起，多见于老年患者，也可能是纤维肌性发育不良等原因导致。肾静脉血栓形成：肾静脉血栓形成会影响肾脏的血液回流，导致肾脏淤血，长期淤血会损伤肾脏组织，引发肾萎缩。这种情况可见于血液高凝状态的患者，如肾病综合征患者等。
三、先天性因素及其他
先天性肾发育不良：部分人出生时就存在肾脏发育不良的情况，肾脏体积较正常偏小，随着年龄增长，可能出现肾萎缩相关表现。梗阻性肾病：尿路结石、肿瘤等原因导致尿路梗阻，尿液排出受阻，会引起肾盂积水，长期肾盂积水会压迫肾实质，导致肾萎缩。例如输尿管结石堵塞输尿管，就可能引发梗阻性肾病进而导致肾萎缩。