秋季腹泻是由轮状病毒引起的。轮状病毒是一种双链RNA病毒，主要感染小肠上皮细胞，从而造成细胞损伤和腹泻。
轮状病毒主要通过粪-口途径传播，也可以通过气溶胶形式经呼吸道感染而传播。它在室温下可存活数天，在粪便中可存活数周。轮状病毒感染好发于秋季，故名秋季腹泻。
儿童是秋季腹泻的主要发病人群，感染后一般潜伏期为1-3天，起病急，常伴有发热和上呼吸道感染症状。病初1-2天常发生呕吐，随后出现腹泻，大便次数多、量多、水分多，黄色水样或蛋花样便带少量黏液，无腥臭味。常并发脱水、酸中毒及电解质紊乱。
成人秋季腹泻，多由轮状病毒以外的其他病毒（如肠道腺病毒、杯状病毒、星状病毒、诺如病毒等）感染引起，或由轮状病毒感染后在肠道定植的其他细菌（如侵袭性大肠杆菌、空肠弯曲菌、耶尔森菌等）引起。成人感染轮状病毒后，症状通常较轻，多为自限性。
对于秋季腹泻，目前尚无特效的治疗药物，主要以对症治疗为主，包括纠正脱水、酸中毒及电解质紊乱，调整饮食，预防并发症等。同时，要注意个人卫生，勤洗手，保持饮食卫生，避免食用不洁食物。