萎缩性胃炎患者可在医生的指导下使用以下药物进行治疗：
1.胃黏膜保护剂：如硫糖铝、枸橼酸铋钾等，这类药物可以在胃黏膜表面形成一层保护层，减少胃酸对胃黏膜的刺激，有利于胃黏膜的修复。
2.促胃肠动力药：如多潘立酮、莫沙必利等，可增强胃排空，促进胃肠蠕动，缓解消化不良症状。
3.助消化药：如复方消化酶、乳酶生等，有助于改善食欲，促进食物的消化吸收。
4.抗抑郁药或抗焦虑药：如果患者伴有明显的焦虑、抑郁等情绪问题，医生可能会建议使用这类药物，以缓解症状，提高治疗效果。
5.根除幽门螺杆菌感染的药物：如果萎缩性胃炎与幽门螺杆菌感染有关，需要使用四联疗法进行根除治疗，即质子泵抑制剂+两种抗生素+铋剂。
需要注意的是，药物的使用应遵循个体化原则，医生会根据患者的具体情况制定合理的治疗方案。此外，患者在日常生活中还应注意饮食调理，避免食用辛辣、油腻、刺激性食物，以及戒烟戒酒。同时，保持良好的心态，避免过度紧张和焦虑，也有助于病情的恢复。