转移因子口服液和匹多莫德口服液的功效不一样。转移因子口服液是免疫调节药，可增强或抑制体液免疫和细胞免疫功能；匹多莫德口服液是免疫刺激调节剂，适用于机体免疫功能低下的患者，并可用于预防急性感染，缩短病程，减少疾病的严重程度，可作为急性感染期的辅助用药。
需要注意的是，这两种药物都需要在医生的指导下使用，根据患者的具体情况选择合适的药物和剂量。同时，在使用过程中可能会出现一些不良反应，如发热、头痛、恶心等，需要密切观察，如果出现严重不适，应及时就医。此外，对于过敏体质者、孕妇及哺乳期妇女等特殊人群，使用前应咨询医生的意见。