灰指甲真菌感染是一种常见的疾病，治疗灰指甲真菌感染的药物有很多，以下是一些常用的药物：
1.外用药物：
阿莫罗芬搽剂：这是一种广谱抗真菌药物，能有效抑制灰指甲真菌感染。使用时，先将病甲锉薄，然后涂抹阿莫罗芬搽剂，每天1-2次。
环吡酮胺乳膏：对皮肤癣菌、酵母菌等有较强的抑制作用，可用于灰指甲的治疗。使用时，将药膏均匀涂抹于患处，每日1-2次。
2.口服药物：
伊曲康唑胶囊：广谱抗真菌药物，适用于灰指甲的治疗。具体用法为：第1、2周每天服用2次，每次200mg；之后每周服用1-2次，每次200mg。
特比萘芬片：也是一种广谱抗真菌药物，对灰指甲有较好的治疗效果。用法为：每天服用1次，每次250mg，连续服用6-12周。
需要注意的是，灰指甲真菌感染的治疗需要一定的时间，患者应按照医生的建议坚持用药。同时，在治疗期间，应注意个人卫生，保持足部清洁干燥，避免与他人共用鞋袜、拖鞋等物品，以防交叉感染。