初孕孕酮低可能会导致肚子疼，但也不是绝对的。孕酮是维持妊娠所必需的孕激素，其水平低可能会影响胚胎的发育，导致肚子疼或阴道流血等先兆流产的症状。但有些孕妇孕酮低却没有任何症状，这可能与个体差异有关。
如果在怀孕早期出现肚子疼或阴道流血等异常情况，应及时就医，进行孕酮、血HCG、B超等检查，以确定胚胎的发育情况。如果孕酮水平低，医生会根据具体情况给予补充孕激素的治疗，以提高孕酮水平，维持妊娠。
此外，在孕早期，孕妇还应注意休息，避免剧烈运动和性生活，保持心情愉快，以利于胚胎的发育。
需要注意的是，肚子疼也可能是其他原因引起的，如宫外孕、子宫肌瘤等。因此，如果出现肚子疼，应及时就医，明确原因，以便采取相应的治疗措施。