在月经没有完全干净的情况下进行性行为，一般不会怀孕，但可能会对女性健康造成一些影响，具体如下：
1.细菌感染：月经期间，女性的子宫内膜会脱落，子宫颈口张开，此时进行性行为，容易将细菌带入子宫，引起感染。此外，月经期间女性的免疫力较低，更容易感染细菌。
2.子宫内膜异位症：月经期间进行性行为，可能会导致经血倒流，使子宫内膜碎片种植在子宫以外的部位，引起子宫内膜异位症。子宫内膜异位症会导致痛经、性交痛、月经不调等症状，严重影响女性的生活质量。
3.免疫性不孕：月经期间进行性行为，可能会导致女性体内产生抗精子抗体，引起免疫性不孕。
需要注意的是，以上只是一些可能的影响，并不是所有女性都会出现这些问题。如果女性在月经期间进行了性行为，并且出现了腹痛、阴道出血、白带异常等症状，应及时就医，以便及时发现和治疗潜在的问题。此外，为了女性的健康，建议在月经完全干净后再进行性行为。同时，也要注意避孕，避免意外怀孕。