引起新生儿喉咙有痰的原因主要有以下几点：
1.喉部结构发育不完善：新生儿的喉部呈漏斗状，喉腔相对狭窄，声门裂相对狭小，软骨柔软，黏膜柔嫩而富有血管及淋巴组织，轻微炎症即可导致声嘶和吸气性呼吸困难。
2.呼吸道感染：新生儿的呼吸道较短且狭窄，黏膜柔嫩，血管丰富，纤毛运动较差，难以有效清除呼吸道内的分泌物，容易发生呼吸道感染。
3.胃食管反流：新生儿的胃容量较小，且呈水平位，贲门括约肌发育不完善，容易发生胃食管反流，导致胃酸和其他内容物刺激呼吸道，引起咳嗽和咳痰。
4.环境因素：如果新生儿所处的环境温度过低、湿度过小或空气污染严重，都可能刺激呼吸道，导致分泌物增多，引起喉咙有痰。
5.其他：如果新生儿存在先天性心脏病、免疫缺陷等疾病，也可能导致呼吸道感染和分泌物增多。
针对新生儿喉咙有痰的情况，可以采取以下措施：
1.保持室内空气湿润，可以使用加湿器增加空气湿度。
2.给新生儿适量喂水，有助于稀释痰液。
3.经常给新生儿翻身、拍背，促进痰液排出。
4.如果新生儿喉咙有痰的情况较为严重，影响呼吸或出现咳嗽、发热等症状，应及时就医，在医生的指导下进行治疗。