孕16周时发现宫腔积液90x9mm，可能是先兆流产、宫颈机能不全、宫腔感染等原因引起的，需要根据具体情况采取相应的治疗措施，以下是一些可能的治疗方法：
1.卧床休息：尽量减少活动，多卧床休息，避免劳累和剧烈运动。
2.补充孕激素：如果是孕激素水平不足引起的宫腔积液，可以在医生的指导下使用孕激素类药物，如黄体酮胶囊、地屈孕酮片等，以提高孕激素水平，促进子宫收缩，减少宫腔积液的形成。
3.抗感染治疗：如果是宫腔感染引起的宫腔积液，需要使用抗生素进行抗感染治疗，如头孢呋辛酯片、阿莫西林胶囊等。
4.宫颈环扎术：如果是宫颈机能不全引起的宫腔积液，在孕14-20周时，需要进行宫颈环扎术，以减少宫腔积液的形成，保证胎儿的安全。
5.其他治疗：如果宫腔积液持续存在或伴有阴道出血、腹痛等症状，可能需要进行其他治疗，如清宫术、输血等。
需要注意的是，以上治疗方法需要在医生的指导下进行，根据具体情况选择合适的治疗方案。同时，孕妇在治疗期间需要注意个人卫生，保持外阴清洁，避免感染。饮食上要注意营养均衡，多吃一些富含蛋白质、维生素等营养物质的食物，如鸡蛋、牛奶、瘦肉、新鲜的蔬菜和水果等。此外，孕妇还需要定期进行产前检查，密切关注胎儿的发育情况。如果出现阴道出血、腹痛等异常情况，应及时就医。