大拇指根部疼的原因主要有以下几点：
1.腱鞘炎：
狭窄性腱鞘炎：常发生于拇指根部，与长期过度使用拇指有关，如频繁使用拇指进行握拳、伸指等动作。
桡骨茎突狭窄性腱鞘炎：好发于中年女性，与手部及腕部活动过多有关，表现为桡骨茎突处疼痛、肿胀，拇指活动时疼痛加重。
2.关节炎：
拇指指间关节炎：可由创伤、感染、退变等因素引起，导致关节软骨损伤、增生，从而引起疼痛、肿胀、活动受限等症状。
类风湿关节炎：可侵犯全身多个关节，包括拇指关节，导致关节肿胀、疼痛、畸形。
3.感染：
甲沟炎：甲沟及其周围组织的感染，可引起大拇指根部红肿、疼痛，严重时可形成脓肿。
化脓性指头炎：手指末节的感染，可导致指头肿胀、疼痛，甚至出现波动感。
4.其他：
外伤：拇指根部的直接外伤，如扭伤、挫伤等，可导致局部软组织损伤，引起疼痛。
肿瘤：拇指根部的肿瘤，如腱鞘巨细胞瘤、内生软骨瘤等，也可引起疼痛。
全身性疾病：如痛风、强直性脊柱炎等，也可累及拇指根部关节，导致疼痛。
需要注意的是，大拇指根部疼的原因可能较为复杂，有时可能需要进一步检查，如X线、CT、血液检查等，以明确诊断。在病因未明之前，应避免过度使用拇指，注意休息，可局部热敷、按摩，以缓解疼痛。如果疼痛持续不缓解或加重，应及时就医，以便进行针对性治疗。