月经还没有完全结束时使用安全套进行性生活，可能会对身体造成不良影响，具体如下：
1.感染：月经期间，子宫内膜脱落，子宫颈口张开，此时进行性生活，容易将细菌带入子宫，引起感染。使用安全套可以在一定程度上减少感染的风险，但并不能完全避免。
2.子宫内膜异位症：月经期间进行性生活，可能会导致经血倒流，使子宫内膜碎片种植在子宫以外的部位，引起子宫内膜异位症。这可能会导致痛经、性交痛等症状，严重时还可能影响生育。
3.免疫性不孕：在月经期间进行性生活，可能会导致免疫反应，使女性产生抗精子抗体，从而引起免疫性不孕。
4.其他：月经期间进行性生活，还可能会导致月经失调、盆腔炎等妇科疾病。
因此，建议在月经完全结束后再进行性生活，以减少对身体的伤害。同时，使用安全套也可以在一定程度上降低感染和避孕的风险，但并不能完全避免。在使用安全套时，需要注意正确的使用方法，并选择质量可靠的产品。如果出现异常症状，应及时就医。此外，对于月经不规律、患有妇科疾病等特殊人群，更应注意避免在月经期间进行性生活。