手指甲有轻微下凹可能是由以下原因引起的：
1.营养不良：缺乏某些营养素，如铁、蛋白质、维生素等，可能导致手指甲变薄、下凹。此外，长期的节食、消化不良等也可能影响营养吸收，导致指甲异常。
2.缺铁性贫血：这是最常见的原因之一。缺铁会影响血红蛋白的合成，导致贫血，进而影响指甲的正常生长。除了指甲下凹外，还可能伴有疲劳、乏力、气短等症状。可通过血常规检查确诊，治疗通常采用口服铁剂。
3.扁平苔藓：一种自身免疫性疾病，可影响皮肤和指甲。除了指甲下凹外，还可能出现红斑、鳞屑等症状。治疗方法包括外用药物、口服药物等，具体治疗方案应根据病情而定。
4.银屑病：这是一种慢性炎症性皮肤病，指甲病变是其常见表现之一。指甲可能出现凹陷、增厚、变色等。治疗方法包括外用药物、光疗、系统治疗等，需根据病情严重程度选择合适的治疗方案。
5.其他原因：真菌感染、湿疹、心脏病、甲状腺功能减退等也可能导致手指甲下凹。
如果发现手指甲有轻微下凹，建议及时就医，进行相关检查，以确定具体原因。医生可能会根据具体情况进行进一步的检查和治疗。此外，保持均衡的饮食、摄入足够的营养、避免过度劳累和压力等，有助于维持指甲的健康。