子宫内膜异位症最首发的症状是痛经,痛经往往是继发性、逐渐加重的。这些妇女有可能年轻候也有过痛经,结婚后或生孩子以后就逐渐消失了,但是过上若干年以后又开始逐渐出现了经期的疼痛且这种疼痛是逐渐加重的,越来越重甚至可以变为慢性盆腔痛。在月经期有明显的疼痛甚至需要口服各种药物来止痛,但是在非月经期也有慢性的下腹痛,主要疼痛的部位是腰骶部、下腹、盆腔中部甚至可以放散到会阴部、肛门、大腿,甚至有的患者痛不欲生,有一部分就是在平时出现性交痛,这些疼痛不一定和病灶大小是一致的。在临床工作中经常会发现痛经非常明显的妇女并没有比较大的卵巢囊肿或是可以触及到的比较大的病灶,但是少部分患者是没有痛经的,大概有20%-30%并没有痛经,痛经是和病灶和位置和神经的侵犯有关。