碘伏与碘酒的用途区别主要在于适用部位和使用方法的不同。
碘伏是单质碘与聚乙烯吡咯烷酮的不定型结合物，是以水为溶媒，对皮肤黏膜无刺激，毒性低，作用持久。可用于皮肤、黏膜的消毒，也可处理烫伤、滴虫性阴道炎、霉菌性阴道炎、皮肤霉菌感染等。使用时，用碘伏消毒后，通常无需脱碘。
碘酒也叫碘酊，是碘和碘化钾的乙醇溶液，能渗入皮肤杀死细菌，主要用于手术部位的消毒和感染部位的消毒。由于碘酒的刺激性较大，在使用碘酒消毒后，需要用酒精进行脱碘。
需要注意的是，对碘过敏者、甲状腺疾病患者以及新生儿，应避免使用碘酒。另外，使用碘伏和碘酒时，应避免接触到眼睛和口腔。如果不小心接触到，应立即用清水冲洗。如果使用过程中出现过敏反应，应停止使用，并及时就医。同时，这两种消毒剂都不能与红药水同时使用，否则会产生有毒的碘化汞。