1.感染性疾病：感染性疾病是不明原因发热最常见的原因之一，可由细菌、病毒、真菌、支原体等多种病原体引起。其中，结核病、慢性肾盂肾炎、布鲁氏菌病、感染后低热等较为常见。此外，像艾滋病这类疾病也会导致长期低热。
2.血液系统疾病：血液系统疾病也可能导致长期低热，如白血病、淋巴瘤、再生障碍性贫血等。这些疾病可能会影响正常的造血功能，导致白细胞数量异常，从而引起发热。
3.恶性肿瘤：恶性肿瘤也是不明原因发热的一个重要原因，特别是一些晚期恶性肿瘤，如肝癌、肺癌、胃癌等。恶性肿瘤细胞可能会产生内源性致热源，导致发热。
需要注意的是，不明原因低热持续3个月是一个较长的时间，可能会对身体健康造成较大影响。建议及时就医，进行全面的检查和诊断，以确定病因并采取相应的治疗措施。