怀孕39周肚子隐隐作痛，可能是以下原因引起：
1.假性宫缩：怀孕39周时，子宫肌肉较为敏感，可能会出现不规则的宫缩，即假性宫缩。这是一种正常的生理现象，通常持续时间较短，间隔时间较长，且无明显规律，不会引起宫颈口扩张和胎儿娩出。
2.胎儿下降：怀孕39周时，胎儿已经发育成熟，胎位逐渐下降，进入骨盆，可能会压迫腹部和盆腔组织，引起疼痛。这种疼痛通常较为明显，且可能伴有尿频、腰酸等症状。
3.胎盘早剥：胎盘早剥是指胎盘在胎儿娩出前部分或全部从子宫壁剥离，是一种严重的妊娠期并发症。其主要表现为突然发生的持续性腹痛，伴有或不伴有阴道出血。
4.其他：除上述原因外，孕妇腹部受到外力撞击、妊娠期高血压疾病、早产等也可能导致怀孕39周时肚子隐隐作痛。
需要注意的是，每个孕妇的情况都可能不同，如果疼痛持续时间较长、程度加重、伴有阴道出血或其他异常症状，应及时就医，进行详细的产前检查和评估，以确保孕妇和胎儿的安全。