引起三岁儿童膝盖疼的原因有很多，常见的包括以下几种：
1.生长痛：三岁左右的孩子常有生长痛，这是一种正常的生理现象。孩子活动量相对较大，长骨生长较快，与局部肌肉筋腱的生长发育不协调，导致了生理性疼痛的发生。疼痛部位多在膝、小腿和大腿的前面，偶尔会在腹股沟区，一般为双侧，不伴有红肿、发热的症状。疼痛通常发生在黄昏前后，过度运动、疲劳可使症状加重，休息后自行缓解。这种疼痛一般不需要特殊治疗，家长可以通过按摩、热敷等方式缓解孩子的不适。
2.外伤：孩子在活动或玩耍时，可能会不小心摔倒或碰撞到膝盖，导致膝盖受伤，引起疼痛。如果孩子的膝盖出现红肿、淤青或活动受限等症状，家长应及时带孩子就医。
3.感染：孩子的膝盖部位如果发生感染，也会引起疼痛，常见的有滑膜炎、骨髓炎等。此外，孩子如果患上了流感、手足口病等病毒感染性疾病，也可能会出现膝盖疼痛的症状。
4.其他：三岁儿童膝盖疼还可能与一些疾病有关，如风湿病、幼年特发性关节炎等。如果孩子的疼痛持续时间较长，或伴有其他症状，如发热、皮疹、关节肿胀等，家长应及时带孩子就医，进行详细的检查和诊断。
需要注意的是，每个孩子的情况都可能不同，如果家长对孩子的膝盖疼感到担忧或不确定原因，最好咨询医生的意见。医生会根据孩子的具体情况进行详细的检查和诊断，并给出相应的治疗建议。