肺动脉栓塞术后肺不张可采取以下方法进行治疗。
1.一般治疗：患者应卧床休息，避免剧烈运动，同时给予高浓度吸氧，以纠正低氧血症。
2.药物治疗：可使用抗生素预防和控制肺部感染，使用支气管扩张剂舒张支气管，缓解气道痉挛，还可使用祛痰药促进痰液排出。
3.呼吸功能锻炼：包括深呼吸、有效咳嗽、排痰训练等，有助于增加肺部通气功能，促进肺复张。
4.物理治疗：可采用胸部叩击、震颤、体位引流等方法，促进痰液排出，改善肺不张。
5.手术治疗：如果肺不张较为严重，或经上述治疗方法无效，可能需要进行手术治疗，如支气管镜下肺泡灌洗术、肺叶切除术等。
需要注意的是，肺动脉栓塞术后肺不张的治疗应根据患者的具体情况制定个性化的治疗方案。在治疗过程中，患者应密切配合医生的治疗，积极进行呼吸功能锻炼，注意休息，保持呼吸道通畅，以促进病情的恢复。