如果新生儿在打完疫苗后晚上哭闹，可以考虑以下原因和应对方法：
1.注射部位疼痛：疫苗注射后，可能会引起注射部位的疼痛和不适，导致新生儿哭闹。可以检查注射部位是否有红肿、硬结等异常，如有需要，可以在医生的指导下使用止痛药物。
2.全身反应：部分新生儿在接种疫苗后，可能会出现全身反应，如发热、乏力、食欲减退等，这些症状也可能导致哭闹。可以测量体温，观察其他症状的出现情况。如果体温超过38.5℃，可以在医生的指导下使用退烧药。
3.过敏反应：虽然这种情况比较罕见，但也不能完全排除。如果新生儿出现皮疹、呼吸困难、过敏性休克等症状，应立即就医，进行抗过敏治疗。
4.心理因素：新生儿可能对注射过程感到恐惧或不安，尤其是在晚上，这种情绪可能会导致哭闹。可以尝试安抚新生儿，如抱抱、拍拍、轻声安慰等，让其感到安全和舒适。
5.其他不适：新生儿在打完疫苗后，可能会出现其他不适，如腹胀、腹泻等，这些症状也可能导致哭闹。可以检查新生儿的腹部，观察是否有腹胀、肠鸣音亢进等情况。如有需要，可以在医生的指导下使用益生菌、蒙脱石散等药物。
需要注意的是，如果新生儿哭闹持续时间较长、症状加重或出现其他异常情况，应及时就医，以便明确原因并进行相应的处理。同时，在接种疫苗后，应注意观察新生儿的情况，让其多喝水，注意休息，避免剧烈运动和感染。