12岁男孩腿部有时像针刺一样疼，可能与以下原因有关。
生长痛：男孩在生长发育过程中，骨骼生长迅速，而肌肉和韧带的生长相对较慢，导致肌肉和韧带被牵拉，从而引起疼痛。这种疼痛通常发生在夜间，腿部无红肿、发热等异常，通过按摩、热敷等方式可缓解。
外伤：如果腿部受到碰撞、挤压等外伤，可能导致局部软组织损伤，出现疼痛。此外，剧烈运动也可能引起腿部肌肉拉伤，导致疼痛。
感染：如腿部皮肤感染、骨髓炎等，可出现腿部疼痛，还可能伴有局部红肿、发热等症状。
其他：如缺钙、良性肌炎、腰椎间盘突出症等，也可能导致腿部疼痛。
如果男孩腿部疼痛持续时间较长、疼痛剧烈、伴有其他症状，或影响正常活动，建议及时就医，进行详细的检查，如血常规、X线、CT等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，家长应注意观察男孩的腿部情况，避免剧烈运动，注意保暖，合理饮食，补充营养。