怀孕前三个月不能同房的主要原因是为了保障孕妇和胎儿的健康。以下是具体分析：
1.容易引起流产：怀孕前三个月，胎盘尚未完全形成，胚胎在子宫壁上附着得还不够牢固。此时进行性生活，可能会刺激子宫收缩，导致流产。特别是有过自然流产史、习惯性流产史、怀孕后有前置胎盘或低置胎盘等情况的孕妇，更应该避免同房。
2.增加感染风险：在性生活中，男性的阴茎可能会带入细菌和病毒，增加孕妇感染的风险。这些感染可能会影响胎儿的发育，甚至导致畸形。有过多次人流史、妇科炎症的孕妇，更应该注意这一点。
3.影响胎儿发育：怀孕前三个月，胎儿正处于器官形成的关键时期。频繁的性生活可能会影响胎儿的正常发育，导致胎儿发育迟缓、畸形等问题。
需要注意的是，每个孕妇的身体状况都不同，如果有任何疑问或担忧，应该及时咨询医生的意见。此外，在怀孕期间，孕妇应该保持良好的生活习惯，如均衡饮食、适量运动、保持心情愉悦等，这有助于胎儿的健康发育。