药流第三天不可以不在医院。药流第三天通常需要在医院观察，以确保孕囊完全排出，以及身体的恢复情况。以下是一些需要考虑的因素：
1.孕囊排出：药流第三天，孕囊通常会排出体外。在医院，医生可以密切观察孕囊的排出情况，确保其完全排出。如果孕囊排出不完全，可能需要进行进一步的处理，如清宫手术。
2.出血情况：药流可能会导致大量出血，尤其是在孕囊排出后。在医院，医生可以及时处理出血情况，采取必要的措施，如止血治疗。
3.身体恢复：药流后，身体需要一定的时间恢复。在医院，医生可以监测身体的各项指标，如血压、脉搏、体温等，确保身体恢复良好。如果出现异常情况，医生可以及时进行处理。
4.并发症处理：药流可能会引发一些并发症，如感染、药流不全等。在医院，医生可以及时发现并处理这些并发症，避免病情加重。
此外，药流后需要注意休息，避免劳累和剧烈运动，保持外阴清洁，避免感染。同时，需要按照医生的要求进行复查，以确保身体恢复良好。
因此，药流第三天不可以不在医院。为了确保身体的健康和安全，建议在药流第三天在医院观察。如果因为工作原因无法在医院观察，也可以在药流前与医生沟通，了解可能的风险和注意事项，并根据医生的建议进行安排。