男性尿道上面长疙瘩可能由多种原因引起，以下是一些可能的情况：
1.尖锐湿疣：由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起，主要通过性接触传播。初期为淡红色或肤色丘疹，逐渐增大增多，形成菜花状、鸡冠状赘生物。可伴有瘙痒、疼痛、性交出血等症状。治疗方法包括物理治疗、药物治疗和免疫疗法。
2.珍珠状阴茎丘疹：常见于青壮年男性，与包皮过长、局部刺激有关。丘疹多发生在龟头边缘与冠状沟交界处，为珍珠状白色、黄色或红色小丘疹，互不融合，无压痛。一般无自觉症状，对健康无影响，无需特殊治疗。
3.皮脂腺异位症：由于皮脂腺发育的生理性变型和皮脂腺增生所致。好发于口腔黏膜、阴茎龟头，为针头大小、孤立的黄白色小丘疹。一般无自觉症状，无需治疗。
4.传染性软疣：由传染性软疣病毒感染引起，可通过直接接触或间接接触传播。表现为半球形丘疹，中央有脐凹，可挤出白色乳酪样物质。治疗方法主要是刮除，然后涂以2%碘酊或3%三氯醋酸。
5.阴茎中线囊肿：是一种发生于阴茎中线的囊性肿物，可能与先天发育异常或局部损伤有关。多位于龟头下方，呈圆形或椭圆形，大小不一，表面光滑，无压痛。一般无自觉症状，无需治疗。
6.其他：如阴茎硬结症、尿道肉阜、肿瘤等也可能导致尿道上面长疙瘩。
如果发现尿道上面长疙瘩，应及时就医，明确诊断。医生会根据具体情况选择合适的治疗方法。同时，注意个人卫生，保持局部清洁干燥，避免搔抓和摩擦，避免不洁性生活。