尿道口上方有小疙瘩，没有不洁性关系，可能是以下原因：
1.皮脂腺异位症：皮脂腺异位症是一种良性增生性疾病，可能与内分泌、局部刺激或创伤有关。尿道口周围的皮脂腺发育异常，可出现针头大小的淡黄色丘疹，无自觉症状，一般不需要治疗。
2.珍珠状阴茎丘疹：珍珠状阴茎丘疹是一种发生在阴茎冠状边缘的丘疹，可能与生理发育变异、局部刺激等有关。丘疹多为白色、肤色或淡红色，无压痛，无破溃，可持续存在数年，一般不需要治疗。
3.尖锐湿疣：尖锐湿疣是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的性传播疾病。主要表现为外生殖器及肛门周围的赘生物，可逐渐增大、增多，呈菜花状或乳头状。醋酸白试验阳性，HPV检测阳性。治疗方法包括物理治疗、药物治疗和免疫疗法等。
4.假性湿疣：假性湿疣是一种良性乳头瘤病，可能与念珠菌感染、长期慢性炎症刺激有关。主要表现为小阴唇内侧对称性的鱼子样或息肉样丘疹，无自觉症状。醋酸白试验阴性，HPV检测阴性。一般不需要治疗，如有治疗需求，可采用激光、冷冻等方法去除疣体。
如果尿道口上方的小疙瘩持续存在或伴有其他症状，建议及时就医，明确诊断。同时，要注意保持局部清洁卫生，避免搔抓和摩擦，避免不洁性生活。