祖师麻注射液与复方当归注射液是可以同时使用的，但需要在医生的指导下进行。
祖师麻注射液的主要成分是祖师麻，具有祛风除湿、活血止痛的功效，主要用于治疗风湿痹痛、关节炎、腰腿疼痛等。复方当归注射液的主要成分是当归、川芎、红花，具有活血化瘀、通经止痛的功效，主要用于治疗痛经、跌打损伤等。
虽然祖师麻注射液与复方当归注射液的成分不同，但它们的功效相似，且没有明确的药物相互作用。因此，在医生的指导下，同时使用这两种注射液可能会增强疗效，但也可能增加不良反应的发生风险。
需要注意的是，这两种注射液都属于中药注射液，使用时需要注意以下几点：
1.过敏体质者慎用。
2.孕妇禁用。
3.哺乳期妇女慎用。
4.年老体弱者、儿童、高血压、心脏病、糖尿病等患者应在医生指导下使用。
5.严格按照说明书的用法用量使用，不得超剂量、过快滴注。
6.用药期间应密切观察患者的反应，如出现过敏、发热、寒战等不良反应，应立即停止使用，并采取相应的治疗措施。
总之，祖师麻注射液与复方当归注射液可以同时使用，但需要在医生的指导下进行，并注意观察不良反应的发生。如果有任何疑问，应及时咨询医生。