3个月后健康证丢失可以补办，补办健康证的具体流程和时间限制如下：
1.准备材料：身份证原件及复印件、免冠一寸照片两张。
2.申请补办：持上述材料到当地卫生健康委员会或其指定的医疗机构申请补办健康证。
3.缴费：按照当地物价部门核定的收费标准缴纳补办费用。
4.体检：按照要求进行健康体检，包括内外科、胸透、肝功能等项目。
5.领证：体检合格后，一般在7-10个工作日内可以领取补办的健康证。
需要注意的是，不同地区的补办流程和时间限制可能会有所差异，具体情况可以咨询当地的卫生健康委员会或相关医疗机构。此外，健康证的有效期为一年，建议在有效期届满前及时进行体检和换证。