例假结束后同房有腹痛、褐色分泌物，可能与以下因素有关。
1.妇科炎症：如阴道炎、宫颈炎、盆腔炎等，炎症可能导致阴道或子宫颈黏膜充血、水肿，在同房时受到刺激，容易出现腹痛和褐色分泌物。
2.子宫内膜异位症：子宫内膜异位症是指子宫内膜组织生长在子宫腔以外的部位，在同房时，可能会引起腹痛和褐色分泌物。
3.排卵期出血：如果例假结束后正好处于排卵期，由于雌激素水平短暂下降，使子宫内膜失去激素的支持而出现部分子宫内膜脱落，引起有规律性的阴道出血，这是正常的生理现象，一般不需要特殊处理。
4.其他：如子宫肌瘤、子宫腺肌症、宫颈癌等，也可能导致同房后出现腹痛和褐色分泌物。
如果出现这种情况，建议及时就医，进行相关检查，如白带常规、B超、宫颈癌筛查等，以明确原因，并采取相应的治疗措施。同时，在治疗期间应避免同房，注意个人卫生，保持外阴清洁。