奥利司他胶囊可能对胎儿有不良影响，孕妇及哺乳期妇女禁用。奥利司他胶囊主要用于肥胖或体重超重患者（体重指数≥24）的治疗。奥利司他胶囊会引起胃肠道不良反应，其常见不良反应为：油性斑点、胃肠排气增多、脂肪（油）性大便、脂肪泻、大便次数增多和大便失禁。随膳食中脂肪成分增加，发生率也相应增高。大部分病人用药一段时间后可改善。较多出现的胃肠道急性反应有：腹痛/腹部不适、胃肠胀气、水样便、软便、直肠痛/直肠部不适、牙齿不适、牙龈不适。
此外，奥利司他胶囊在动物实验中观察到有胎儿毒性和致畸作用。目前还没有关于人类的充分研究。因此，孕妇及哺乳期妇女禁用奥利司他胶囊。如果在用药期间发现怀孕，应咨询医生或药师，权衡利弊后决定是否继续妊娠。