阴茎内灼烧感、排尿时刺痛，可能与尿道炎、膀胱炎、前列腺炎等疾病有关，也可能是其他因素引起。具体如下：
1.尿道炎：多由淋球菌或非淋球菌感染引起，也可由其他病原体感染所致。患者尿道口常有黏液性或脓性分泌物，排尿时可有阴茎内灼烧感、疼痛，有时还可出现尿急、尿频等症状。
2.膀胱炎：膀胱位于尿道内口下方，炎症可刺激膀胱颈部和三角区，导致尿频、尿急、尿痛，有时也会出现阴茎内灼烧感。
3.前列腺炎：前列腺位于膀胱下方，与尿道相通。当前列腺发生炎症时，可刺激尿道，导致排尿时疼痛、阴茎内灼烧感，还可能伴有会阴部、耻骨上区疼痛，以及性功能障碍、精神神经症状等。
4.其他：
尿道结石：结石可刺激尿道黏膜，导致排尿时疼痛、阴茎内灼烧感，还可能伴有排尿困难、血尿等症状。
尿道损伤：如骑跨伤、器械检查等，可导致尿道黏膜损伤，引起局部炎症，出现阴茎内灼烧感、排尿时刺痛。
其他：尿道口息肉、包茎、包皮过长等，也可能引起排尿时疼痛。
此外，一些全身性疾病，如糖尿病、血液病等，也可能导致尿道炎症，出现类似症状。
如果出现阴茎内灼烧感、排尿时刺痛，建议及时就医，进行尿常规、尿培养、尿道分泌物涂片等检查，以明确病因，并进行相应的治疗。同时，应注意个人卫生，多喝水，勤排尿，避免憋尿，有助于病情恢复。