药流后12天流咖啡色血，可能是以下原因引起：
1.药流不全：药流后子宫内有残留的胚胎组织，会导致出血时间延长，出现咖啡色分泌物。
2.子宫收缩不良：药流后子宫需要收缩恢复到正常大小，如果子宫收缩不良，会导致出血时间延长。
3.感染：药流后如果不注意个人卫生，容易引起感染，导致子宫内膜炎等疾病，出现咖啡色分泌物。
4.内分泌失调：药流后体内激素水平发生变化，可能导致内分泌失调，引起异常子宫出血。
针对药流后12天流咖啡色血的情况，建议采取以下措施：
1.及时就医：药流后出现异常出血，应及时就医，进行B超等检查，明确原因。
2.注意休息：药流后应注意休息，避免过度劳累和剧烈运动。
3.保持个人卫生：药流后应保持外阴清洁，勤换卫生巾，避免感染。
4.注意饮食：药流后应注意饮食，避免辛辣、刺激性食物，多吃富含蛋白质、维生素等营养物质的食物。
5.按照医生建议进行治疗：根据检查结果，医生可能会建议使用促进子宫收缩的药物、止血药物等进行治疗。如果存在感染，还需要使用抗生素进行抗感染治疗。
需要注意的是，药流后应遵医嘱进行复查，以确保身体恢复情况。如果药流后12天仍有咖啡色血流出，建议及时就医，以便明确原因并进行相应的治疗。