药流后13天仍有少量咖啡色血，可能是以下原因引起的：
1.子宫收缩不良：药流后子宫需要收缩以恢复到正常大小，如果子宫收缩不良，可能会导致出血时间延长。
2.残留组织：药流可能无法完全清除子宫内的组织，导致残留。这些残留组织可能会引起炎症和出血。
3.感染：药流后如果发生感染，如子宫内膜炎、盆腔炎等，也会导致出血时间延长和咖啡色分泌物。
4.内分泌失调：药流可能会影响内分泌系统，导致激素水平失衡，从而引起出血异常。
如果药流后13天仍有少量咖啡色血，建议采取以下措施：
1.就医检查：及时就诊，进行B超等检查，以确定子宫内是否有残留组织、是否存在感染等情况。
2.注意休息：药流后需要充分休息，避免过度劳累和剧烈运动，以免影响子宫恢复。
3.保持卫生：保持外阴清洁，勤换卫生巾，避免感染。
4.饮食调整：注意饮食清淡，避免辛辣、刺激性食物，多吃富含蛋白质、维生素等营养物质的食物，有助于身体恢复。
5.按医生建议治疗：根据检查结果，医生可能会建议使用药物促进子宫收缩、抗感染等治疗。如果有残留组织，可能需要进行清宫手术。
需要注意的是，药流后出血时间过长可能会引起贫血、感染等并发症，因此应及时就医，遵循医生的建议进行治疗。同时，药流后应注意观察身体变化，如果出现出血量增多、腹痛等异常情况，应立即就医。此外，药流有一定的失败率，如有必要，可在医生指导下选择其他终止妊娠的方法。