胎儿胆总管囊肿通常不会自行消失。
胎儿胆总管囊肿是一种先天性疾病，是由于胆总管发育异常导致的胆道梗阻。这种囊肿通常会随着胎儿的生长而逐渐增大，如果不进行治疗，可能会导致严重的后果，如胆汁淤积、肝硬化、胆管炎等。
目前，对于胎儿胆总管囊肿的治疗主要有以下几种方法：
1.手术治疗：在胎儿出生后，通过手术切除囊肿，并进行胆道重建。手术治疗的效果较好，但需要在胎儿出生后及时进行。
2.保守治疗：对于一些较小的囊肿，可以通过定期观察、饮食调整等方法进行保守治疗。但这种方法只适用于囊肿较小、没有明显症状的情况。
3.产前诊断：通过产前超声检查等方法，对胎儿的胆总管囊肿进行诊断。如果发现胎儿有胆总管囊肿，可以及时采取相应的治疗措施。
需要注意的是，胎儿胆总管囊肿的治疗需要根据具体情况进行个体化选择。在治疗过程中，需要密切关注胎儿的生长发育情况，以及囊肿的变化情况。同时，家长也需要积极配合医生的治疗，做好术后护理和随访工作。