早上起来尿尿疼可能由以下原因引起：
1.尿道炎：尿道炎是一种常见的泌尿系统感染，可导致尿尿疼痛、尿频、尿急等症状。尿道炎的发生与细菌感染有关，常见的细菌有大肠杆菌、链球菌等。此外，不洁的性生活、个人卫生习惯不良、免疫力下降等也可能导致尿道炎的发生。治疗尿道炎通常采用抗生素治疗，如左氧氟沙星、阿莫西林等。同时，患者应注意个人卫生，多喝水，以促进炎症的消退。
2.膀胱炎：膀胱炎是膀胱的炎症，也可引起尿尿疼痛。除了尿尿疼痛外，膀胱炎还可能伴有尿频、尿急、尿不尽等症状。膀胱炎的发生与细菌感染有关，常见的细菌有大肠杆菌、变形杆菌等。此外，憋尿、尿路梗阻、免疫力下降等也可能导致膀胱炎的发生。治疗膀胱炎通常采用抗生素治疗，如头孢呋辛酯、头孢克洛等。同时，患者应注意休息，多喝水，以促进炎症的消退。
3.前列腺炎：前列腺炎是男性常见的疾病，可引起尿尿疼痛、尿频、尿急、尿不尽等症状。前列腺炎的发生与细菌感染、前列腺充血、免疫因素等有关。此外，性生活频繁、久坐、憋尿、酗酒等也可能导致前列腺炎的发生。治疗前列腺炎通常采用抗生素治疗，如左氧氟沙星、阿奇霉素等。同时，患者应注意休息，避免久坐，多喝水，以促进炎症的消退。
如果早上起来尿尿疼的症状持续不缓解或伴有其他症状，如发热、腰痛、血尿等，应及时就医，明确诊断，并在医生的指导下进行治疗。同时，患者应注意个人卫生，多喝水，避免憋尿，避免食用辛辣刺激性食物。