怀孕三个月右边肚子隐隐作痛，可能是以下原因引起：
1.子宫增大：怀孕后，子宫逐渐增大，可能会牵拉子宫周围的韧带，引起腹部隐痛。这种疼痛通常是轻微的，且多为阵发性。
2.生理性宫缩：怀孕后，子宫会出现生理性宫缩，也可能导致腹部隐痛。这种宫缩通常没有规律，持续时间较短，强度也较弱。
3.胃肠道不适：怀孕后，体内激素水平的变化可能会影响胃肠道功能，导致消化不良、便秘等，从而引起腹部隐痛。
4.其他：如右侧附件炎、右侧输尿管结石等，也可能引起腹部隐痛。
如果疼痛持续时间较长、程度较重，或伴有阴道流血、发热等症状，应及时就医，进行相关检查，以排除先兆流产、宫外孕等异常情况。
在孕期，应注意休息，避免过度劳累，保持心情愉悦。同时，要注意观察腹痛的情况，如果出现异常，应及时就医。此外，还应注意饮食卫生，避免食用不洁食物，预防胃肠道感染。