根据问题需求，治疗甲状腺的医院比较好的有以下几家：
1.北京协和医院：是集医疗、科研、教学为一体的大型综合医院，拥有内分泌科、核医学科等重点科室，在甲状腺疾病的诊断和治疗方面具有较高的水平。
2.四川大学华西医院：是中国西部疑难危急重症诊疗的国家级中心，医院的内分泌代谢科是国家临床重点专科，在甲状腺疾病的治疗方面有丰富的经验。
3.中国人民解放军总医院（301医院）：是全军规模最大的综合性医院，医院的内分泌科是国家重点学科，在甲状腺疾病的治疗方面处于国内领先水平。
4.上海交通大学医学院附属瑞金医院：是一所集医疗、教学、科研为一体的三级甲等综合性医院，内分泌科是国家临床重点专科，在甲状腺疾病的治疗方面有较高的声誉。
5.中国医学科学院北京协和医院：是一所位于北京市东城区，集医疗、科研、教学为一体的大型综合医院。医院的内分泌科是国家重点学科，在甲状腺疾病的治疗方面有较高的水平。
以上内容仅供参考，治疗甲状腺的医院还有很多，建议患者根据自己的实际情况选择适合自己的医院。