大便有真菌孢子是否需要住院，取决于具体情况，一般来说，可能包括以下几种情况：
1.轻微感染：如果真菌孢子感染较轻，没有其他明显症状，医生可能会建议在门诊进行治疗。治疗方法可能包括使用抗真菌药物、调整饮食、注意个人卫生等。在门诊治疗期间，医生会密切观察病情的变化，并根据需要进行调整。
2.严重感染或合并其他疾病：如果真菌孢子感染严重，或患者同时患有其他严重疾病，如免疫系统缺陷、糖尿病等，可能需要住院治疗。住院治疗可以提供更密切的监护和更专业的治疗措施，如静脉输注抗真菌药物、支持性治疗等。
3.病因不明：如果真菌孢子感染的原因不明，或需要进一步明确诊断，医生可能会安排住院进行详细的检查和评估。住院期间可以进行进一步的实验室检查、影像学检查等，以确定病因并制定更合适的治疗方案。
4.治疗反应不佳：如果在门诊治疗或住院治疗过程中，病情没有得到有效控制或出现恶化，医生可能会建议调整治疗方案或进一步检查，甚至可能需要再次住院治疗。
需要注意的是，每个人的情况都不同，治疗方案应根据具体情况制定。在决定是否住院治疗之前，医生会对患者进行全面的评估，并与患者及其家属充分沟通，解释治疗的利弊和风险。患者和家属可以与医生共同商讨，做出最适合自己的决策。
此外，无论是否住院治疗，患者都需要积极配合医生的治疗方案，按时服药、注意饮食和个人卫生，并遵循医生的建议进行随访和复查。如果出现症状加重、发热、腹痛等异常情况，应及时告知医生。