耳朵里有真菌孢子的治疗方法如下：
1.清除耳道内的真菌孢子：可以使用过氧化氢溶液或生理盐水冲洗耳道，将真菌孢子冲洗出来。也可以使用吸引器或吸引管将耳道内的分泌物吸出。
2.使用抗真菌药物：可以使用局部抗真菌药物，如克霉唑、酮康唑等，涂抹在耳道内。也可以口服抗真菌药物，如氟康唑、伊曲康唑等。
3.保持耳道干燥：真菌喜欢潮湿的环境，因此保持耳道干燥非常重要。可以使用吹风机将耳道吹干，或者使用干燥剂将耳道内的水分吸干。
4.注意个人卫生：保持耳道清洁，避免耳道进水，不要使用不洁的物品挖耳。
5.治疗其他疾病：如果耳朵里有真菌孢子是由于其他疾病引起的，如中耳炎、外耳道炎等，需要同时治疗这些疾病。
需要注意的是，以上治疗方法仅供参考，具体治疗方法需要根据个人情况而定。如果症状严重或持续时间较长，建议及时就医，以便获得更专业的治疗建议。