当新生儿出现消化不良哭闹时，可以采取以下治疗方法：
1.调整饮食：如果是母乳喂养，母亲应注意饮食，避免食用辛辣、油腻、刺激性食物；如果是人工喂养，可适当调整奶粉的浓度或更换奶粉品牌。
2.腹部按摩：以宝宝的肚脐为中心，顺时针方向轻轻按摩宝宝的腹部，促进肠胃蠕动，帮助消化。
3.服用益生菌：益生菌可以调节肠道菌群，改善消化不良的症状。可在医生的指导下，给宝宝服用适量的益生菌。
4.药物治疗：如果宝宝的消化不良症状较为严重，可以在医生的指导下，服用一些药物，如胃蛋白酶合剂、多酶片等。
需要注意的是，在给宝宝治疗消化不良的同时，也要注意观察宝宝的精神状态、食欲、大小便等情况，如果宝宝出现发热、呕吐、腹泻等症状，应及时就医。