益生元和益生菌的区别在于：
1.定义不同：益生元是指可以选择性地促进有益菌的生长和代谢，从而改善宿主健康的有机物质；益生菌则是一类对宿主有益的活性微生物，定植于人体肠道、生殖系统内，能产生确切健康功效从而改善宿主微生态平衡、发挥有益作用。
2.来源不同：益生元主要包括各种寡糖类物质（如低聚果糖、低聚半乳糖、低聚异麦芽糖、大豆低聚糖、菊粉等）和多糖类物质（如葡聚糖、甘露聚糖、茁甲基戊聚糖等）；益生菌有细菌和真菌两大来源，包括嗜酸乳杆菌、双歧杆菌、干酪乳杆菌、嗜热链球菌、保加利亚乳杆菌等细菌和酵母。
3.作用机制不同：益生元不能被人体消化吸收，通过选择性地刺激有益菌的生长和代谢，从而改善宿主健康；益生菌则是通过在肠道内定植和生长，调节肠道菌群平衡，产生有益代谢产物，发挥保健作用。
4.稳定性不同：益生元具有较好的稳定性，不易受胃酸和消化酶的影响；益生菌则对环境敏感，容易受到胃酸、胆汁和抗生素等因素的影响，导致其活性降低。
5.摄入方式不同：益生元通常作为一种添加剂添加到食品或饮料中，也可以作为保健品直接服用；益生菌则主要通过口服的方式摄入，常见的有益生菌制剂、酸奶、发酵乳等。
6.效果不同：益生元主要通过改善肠道菌群组成和代谢产物来发挥作用，对肠道健康有一定的益处；益生菌则可以直接调节肠道菌群，改善肠道功能，还可以产生一些有益代谢产物，对免疫系统、心血管系统等有一定的影响。
总之，益生元和益生菌虽然都是对宿主有益的物质，但它们的来源、作用机制、稳定性和摄入方式等方面存在差异。在实际应用中，可以根据个人需求和身体状况选择合适的产品。