肛瘘是肛管或直肠与会阴皮肤相通的肉芽肿性管道，久拖不治可能会引发以下几种危害：
1.肛门失禁：肛管直肠环是由肛管内括约肌、直肠壁纵肌下部、肛管外括约肌的深部及邻近的部分肛提肌纤维共同组成的肌环，对肛管起着括约作用，若肛瘘久拖不治可造成肛管或直肠损伤，导致此肌环失去弹性，从而引起肛门失禁。
2.肛门周围脓肿：肛瘘一旦形成，自愈的机会极少，并带来一系列的危害，首先肛瘘感染发炎后，肛门疼痛剧烈，溃破后脓水污染内裤，脓汁刺激局部皮肤，肛门瘙痒剧烈，久而久之可使身体虚弱消瘦，精神不振，抗病能力下降，发作亦越频繁，形成互为因果。
3.直肠阴道瘘：若肛瘘的瘘管波及到直肠阴道隔，可使直肠阴道瘘管，此时可出现粪便从瘘管排出。
4.其他危害：肛瘘长期得不到治疗会严重影响患者生活，脓液、粪便污染内衣，臭味儿“如影随形”，给患者工作、生活带来不便。肛瘘多次反复发作，脓液可穿破管壁顺括约肌间隙蔓延而形成多发性、复杂性肛瘘，不但给治疗带来困难，而且也影响到肛门的正常生理功能。