肠结核最主要的症状包括：
1.腹痛：多位于右下腹，反映肠结核病变引起的牵涉痛，有时进餐可诱发腹痛伴便意，排便后可有不同程度的缓解。
2.腹泻与便秘：腹泻是溃疡型肠结核的主要表现之一，这是因为进餐可刺激胃酸分泌，增加肠蠕动，因而排便次数增加。粪便呈糊样，一般不含黏液脓血，不伴有里急后重。此外，增生型肠结核多以便秘为主要表现。
3.腹部肿块：主要见于增生型肠结核，肠壁局部增厚形成肿块。常位于右下腹，比较固定，质地中等，伴有轻重不等的压痛。
4.全身症状：主要表现为发热与盗汗。溃疡型肠结核常有低热或中等度热，多为午后低热，可有盗汗，常伴有乏力、消瘦、贫血、营养不良性水肿等症状。