怀孕三个月时需要进行的检查项目主要包括以下几个方面：
1.B超检查：通过B超检查，可以观察胎儿的发育情况，测量胎儿的双顶径、股骨长等指标，判断胎儿是否存在畸形。
2.血常规检查：血常规检查可以了解孕妇的血液情况，包括血红蛋白、白细胞、血小板等，判断是否存在贫血、感染等情况。
3.尿常规检查：尿常规检查可以了解孕妇的尿液情况，判断是否存在蛋白尿、血尿等，以及是否存在泌尿系统感染。
4.肝功能检查：肝功能检查可以了解孕妇的肝脏功能，判断是否存在肝炎、肝功能异常等情况。
5.肾功能检查：肾功能检查可以了解孕妇的肾脏功能，判断是否存在肾炎、肾功能异常等情况。
6.梅毒、艾滋病筛查：这些检查可以排除孕妇是否感染梅毒和艾滋病，保护孕妇和胎儿的健康。
7.地中海贫血筛查：如果孕妇或其家属有地中海贫血基因，需要进行地中海贫血筛查，以判断胎儿是否存在地中海贫血。
8.唐氏综合征筛查：唐氏综合征筛查是一种通过检测孕妇血清中甲胎蛋白、人绒毛膜促性腺激素和游离雌三醇的浓度，并结合孕妇的年龄、孕周等因素，计算胎儿患唐氏综合征的风险值的检查方法。如果唐氏综合征筛查结果为高危，需要进一步进行羊水穿刺或无创DNA检测，以明确诊断。
9.NT检查：NT检查是指胎儿颈项透明层检查，是一种通过超声测量胎儿颈项部皮下无回声透明层最厚的部位，用于评估胎儿是否存在唐氏综合征等染色体异常的检查方法。NT检查的最佳时间是怀孕11-13+6周。
需要注意的是，每个孕妇的情况都不同，医生会根据孕妇的具体情况进行个性化的检查。孕妇在进行产前检查时，应遵循医生的建议，按时进行检查，以确保胎儿的健康发育。