肠镜检查后留下后遗症的原因可能有以下几种：
1.肠道损伤：肠镜检查过程中，可能会对肠道黏膜造成轻微的损伤，如出血、穿孔等。这种情况下，需要及时就医，医生会根据具体情况进行治疗。
2.感染：肠镜检查是一种有创操作，可能会引起肠道感染。如果患者本身免疫力低下，或者检查过程中消毒不严格，就容易发生感染。感染可能表现为发热、腹痛、腹泻等症状。
3.肠道炎症：肠镜检查可能会刺激肠道黏膜，导致炎症反应。这种情况下，患者可能会出现腹痛、腹泻、便秘等症状。
4.心理问题：部分患者在肠镜检查后可能会出现心理问题，如焦虑、抑郁等。这可能与对检查的恐惧、担心检查结果等因素有关。
如果患者在肠镜检查后出现了上述症状，应及时就医，医生会根据具体情况进行诊断和治疗。同时，患者在检查后应注意休息，饮食清淡，避免剧烈运动和重体力劳动。如果患者对肠镜检查有疑虑或担忧，可以与医生充分沟通，了解检查的风险和注意事项。