脚趾三趾旁边的肉一碰就疼，可能与多种原因有关，以下是一些可能的情况：
1.甲沟炎：甲沟及其附近组织刺伤、擦伤、嵌甲或拔“倒皮刺”后造成感染。初起时，指甲一侧的皮下组织发生红、肿、痛，有的可自行消退，有的却迅速化脓。脓液自甲沟一侧蔓延到甲根部的皮下及对侧甲沟，形成半环形脓肿。甲沟炎多无全身症状，如不切开引流，脓肿可向甲下蔓延，成为指甲下脓肿，在指甲下可见到黄白色脓液，使该部指甲与甲床分离。指甲下脓肿变可因异物直接刺伤指甲或指甲下的外伤性血肿感染引起。感染可逐渐蔓延到指甲根部和对侧甲沟，形成指甲周围炎，也可扩散至甲下，形成甲下脓肿。此时疼痛加剧，肿胀明显，在指甲下方可见到黄白色脓液。如果脓液积聚过多，可使整个指甲浮起、脱落。
2.趾疣：寻常疣发生在足跟、跖骨头或跖间的赘生物，称跖疣多由人类乳头瘤病毒所引起，是寻常疣的一种。外伤、摩擦、多汗为跖疣的诱因，足部多汗者，可使表皮软化，更易被病毒感染，从而引发趾疣。初起为一细小发亮的丘疹，后逐渐增大，表面角化，粗糙不平，灰褐、灰黄或污灰色，呈乳头样增殖，摩擦或撞击时易出血。好发于足跟、跖骨头或跖间受压处。
3.鸡眼：鸡眼为嵌入皮内的圆锥形角质栓，一般自针头至黄豆大或更大，若去除致病因素。鸡眼能自行消失。若鸡眼尖端压迫神经末梢，则行走时感觉疼痛。鸡眼好发于足跖前中部第3跖骨头处、砪趾胫侧缘，也见于小趾及第2趾趾背或趾间等突出及易受摩擦部位。
4.胼胝：胼胝为蜡黄色、扁平或稍微隆起的局限性角质肥厚性斑块，质硬而稍透明，边界不清，中央较厚、边缘较薄。好发于掌跖，常对称发生。与职业有关，经常摩擦和受压的部位容易发生，也与个体素质、足畸形或穿鞋不当有关。
5.其他：脚趾三趾旁边的肉一碰就疼还可能与痛风、类风湿关节炎、感染等有关。
如果疼痛持续不缓解或加重，建议及时就医，明确原因，并进行相应的治疗。同时，要注意保持局部清洁，避免感染，避免长时间行走和站立，选择合适的鞋子，避免挤压和摩擦。