阴茎根部长小疙瘩可能由多种原因引起，以下是一些可能的原因：
1.皮脂腺异位症：这是一种良性病变，通常发生在青春期后。病因尚不清楚，可能与内分泌、局部刺激或创伤有关。表现为针头大小的肤色或淡黄色丘疹，可单发或多发，分布在阴茎根部或冠状沟。一般无自觉症状，无需治疗。
2.珍珠状阴茎丘疹：这是一种发生在龟头边缘的丘疹，病因不明，可能与生理发育变异、局部刺激或感染有关。表现为珍珠状、半透明丘疹，环绕龟头排列成一行或多行，无自觉症状。本病对健康无影响，一般无需治疗。
3.尖锐湿疣：这是一种由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的性传播疾病。主要通过性接触传播，少数通过间接接触传播。潜伏期为1-8个月，平均3个月。表现为外生殖器及肛门周围皮肤黏膜湿润区出现丘疹、乳头状、菜花状或鸡冠状肉质赘生物，可伴有瘙痒、疼痛、出血等症状。治疗方法包括物理治疗、药物治疗和免疫疗法。
4.阴茎肿瘤：阴茎肿瘤比较少见，可分为良性和恶性。良性肿瘤如阴茎纤维瘤、脂肪瘤等，恶性肿瘤如阴茎癌等。表现为阴茎上出现肿块、溃疡、出血等症状。治疗方法根据肿瘤的性质、部位和大小而定，早期肿瘤可通过手术切除治愈，晚期肿瘤可能需要放疗、化疗等综合治疗。
5.其他：阴茎根部长小疙瘩还可能是其他原因引起的，如过敏、感染、炎症等。
如果发现阴茎根部长小疙瘩，建议及时就医，明确诊断。如果是良性病变，一般无需治疗；如果是恶性病变，应及时治疗，以免延误病情。同时，应注意个人卫生，避免不洁性行为，减少感染的机会。