阴茎根部有个小硬疙瘩可能是由多种原因引起的，以下是一些可能的原因：
1.皮脂腺囊肿：这是一种常见的皮肤良性肿瘤，通常由于皮脂腺排泄管阻塞，皮脂腺囊状上皮被逐渐增多的内容物膨胀所形成。囊肿呈圆形，位于阴茎根部，单发或多发，质地硬，边界清楚，可以推动。一般无自觉症状，若继发感染时可有疼痛、化脓。
2.传染性软疣：这是由传染性软疣病毒感染引起的传染性皮肤病。初起为米粒大的半球形丘疹，逐渐增大至豌豆大，中心微凹，表面有蜡样光泽，呈灰白色或珍珠色。可以挤出白色乳酪样物质，数目不定，好发于躯干部及四肢，不融合。
3.尖锐湿疣：这是一种由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的性传播疾病。主要通过性接触传播，少数通过间接接触传播。初起为细小淡红色丘疹，以后逐渐增大增多，单个或群集分布，湿润柔软，表面凹凸不平，呈乳头样、鸡冠状或菜花样突起。根部常有蒂，且易发生糜烂渗液，触之易出血。皮损裂缝间常有脓性分泌物郁积，致有恶臭，且可因搔抓而引起继发感染。本病常无自觉症状，部分病人可出现异物感、痛、痒感或性交痛。直肠内尖锐湿疣可发生疼痛、便血、里急后重感。
4.阴茎硬结症：这是一种发生在阴茎海绵体两层筋膜之间的一种结缔组织增生性疾病，多见于中年人，原因尚未明确。可在阴茎背侧或根部摸到一个或几个条索状或椭圆形硬结，小的如绿豆大小，大的像花生米。阴茎勃起时会发生弯曲，并有疼痛，阴茎勃起功能障碍。
5.阴茎癌：这是一种起源于阴茎头、冠状沟和包皮内板黏膜以及阴茎皮肤的恶性肿瘤。多见于包茎和包皮过长者，早期表现为阴茎头或包皮内板处丘疹、疣或溃疡病变，逐渐增大，可出现菜花样肿块，伴恶臭、疼痛和出血。晚期肿瘤可侵犯阴茎海绵体、尿道海绵体，出现相应的症状。
6.其他：阴茎根部的小硬疙瘩还可能是其他疾病的表现，如脂肪瘤、纤维瘤、梅毒、生殖器疱疹等。
如果发现阴茎根部有小硬疙瘩，建议及时就医，进行详细的检查和诊断，以确定病因，并采取相应的治疗措施。在就医前，应注意保持局部清洁，避免搔抓和挤压，以免加重病情。同时，应避免不洁性行为，注意个人卫生，预防感染。