月经过后两天同房是否会怀孕不能一概而论，需根据女性月经周期和月经期长短判断，若月经期较长，月经干净后两天同房可能因精子存活时间长而在排卵日形成受精卵从而怀孕；若月经期较短，此时未排卵且精子很快凋亡，怀孕几率相对较小，总之怀孕几率与女性月经期和月经周期长短有关。
月经过后两天同房是否会怀孕，不能一概而论，需要根据女性的月经周期和月经期的长短来判断。
对于月经周期比较正常的女性，如果月经期较长，比如月经持续七天左右，那么月经干净后两天，大约是月经的第九天左右。若此时同房，精子进入女性体内后一般可存活三天左右，个别可存活到五天。五天后可能正好是排卵日，所以有形成受精卵从而怀孕的可能。
然而，如果女性的月经期较短，比如来三四天就干净了，那么月经干净后两天同房，大约是月经的第六、七天左右。此时，精子在女性体内很快就会凋亡，而此时还未排卵，所以这种情况下同房怀孕的几率相对较小。
总之，月经过后两天同房是否会怀孕，一是要看女性月经期的时间长短，二是要看月经周期的长短。周期越短，排卵时间越早，怀孕的几率就越大。