小针刀疗法是一种介于针灸和手术之间的治疗方法，其治疗疾病的机理包括依据慢性软组织损伤理论、结合中医经络学说理论、基于机体应力动态平衡失调学说理论、依据软组织无菌性损伤学说及参考免疫学说，进入体内后能同时发挥刀的切割松解和针的刺激调节作用，往往能取得更好的治疗效果。
小针刀疗法治疗疾病的机理主要包括以下几个方面：
1.依据慢性软组织损伤理论：根据慢性软组织损伤的病因、病理学理论，该疗法认为慢性软组织损伤是力平衡失调所致，通过对慢性软组织病变部位进行闭合性松解，以达到治疗目的。
2.结合中医经络学说理论：小针刀疗法借鉴了中医经络学说，通过刺激相应的经络穴位，调整人体的气血运行和脏腑功能，从而发挥治疗作用。
3.基于机体应力动态平衡失调学说理论：该理论认为机体的应力动态平衡失调是导致多种疾病的原因之一，小针刀疗法通过调整机体的应力分布，恢复其动态平衡，达到治疗疾病的效果。
4.依据软组织无菌性损伤学说：小针刀疗法针对软组织无菌性损伤进行治疗，通过松解粘连、缓解痉挛等方式，减轻炎症反应，促进损伤组织的修复。
5.参考免疫学说：该疗法可能对机体的免疫系统产生一定的调节作用，提高机体的免疫力，从而有助于疾病的恢复。
小针刀疗法是一种介于针灸和手术之间的治疗方法。它既具有西医刀的作用，又具有中医针的作用。与传统针灸针相比，小针刀的直径相对较粗，刺激量较大。因此，小针刀进入体内后，能够同时发挥刀的切割松解作用和针的刺激调节作用，往往能起到1+1＞2的治疗效果。