早上起来腰痛可能由睡眠姿势等因素致腰背部肌肉受压、腰椎间盘突出等腰部疾病发作、肾结石等内脏系统疾病引起，若腰痛剧烈且休息后难缓解，应及时就医以确定病因并治疗。
早上起来腰痛可能由多种原因引起。
首先，睡眠姿势不正确、床的硬度不合适、腰背部有硬物或其他物件阻挡压迫，都可能导致腰背部肌肉受压，睡醒后出现腰痛。
其次，对于患有腰椎间盘突出或椎管狭窄的患者，睡觉时病情可能发作，引起腰背部酸胀疼痛。即使是轻症的腰椎间盘突出病变，或者有腰背肌肌膜炎、腰肌劳损的患者，不恰当的睡姿也可能引发病症。
最后，一些内脏系统疾病也需排除。如肾结石、胆囊炎可能在夜间发病，女性的盆腔炎也可能导致腰痛。
因此，如果早上起来后腰痛较为剧烈，且休息后难以缓解，建议及时到医院就诊，以确定具体病因并进行相应的治疗。