HPV阴性但有疣体，可能是假阳性结果、其他病毒感染、皮肤病变、免疫功能异常或疣体不典型等原因导致，需要结合临床表现、病史、其他检查结果等综合判断，可能需要重复检测、进行其他病毒检测、进行皮肤病理检查、评估免疫功能、密切观察或治疗疣体等。
HPV阴性但是有疣体，可能是以下原因。
1.假阳性结果：HPV检测可能出现假阳性，尤其是当疣体样本采集不规范、检测方法不准确或患者正在接受免疫抑制治疗时。
2.其他病毒感染：除HPV外，还有其他病毒可以引起疣体，如单纯疱疹病毒、传染性软疣病毒等。
3.皮肤病变：某些皮肤疾病，如扁平苔藓、慢性湿疹等，也可能出现类似疣体的病变。
4.免疫功能异常：免疫功能低下的患者，如AIDS患者、接受免疫抑制剂治疗的患者，容易感染HPV并出现疣体，但HPV检测可能呈阴性。
5.疣体不典型：某些疣体形态不典型，可能导致HPV检测结果阴性。
对于这种情况，需要结合临床表现、病史、其他检查结果等综合判断。以下是一些可能的处理措施。
1.重复检测：如果怀疑HPV检测结果不准确，可以考虑重复检测HPVDNA或进行其他类型的HPV检测，如HPV抗体检测。
2.其他病毒检测：如果怀疑有其他病毒感染，可以进行相应的病毒检测，如单纯疱疹病毒检测、传染性软疣病毒检测等。
3.皮肤病理检查：对于不典型的疣体或疑似其他皮肤疾病，皮肤病理检查可以帮助明确诊断。
4.免疫功能评估：如果患者免疫功能异常，需要进一步评估免疫功能状况，并采取相应的治疗措施。
5.密切观察：对于一些较小、无明显症状的疣体，可以密切观察其变化，如有增大、增多或出现其他异常，应及时就医。
6.治疗疣体：无论病因如何，疣体通常可以通过物理治疗、药物治疗或手术治疗等方法去除。
总之，HPV阴性但有疣体需要综合考虑多种因素，进行全面评估和诊断。在医生的指导下，采取适当的治疗措施，并定期随访，以确保病情得到有效控制。同时，保持良好的生活习惯，增强免疫力，有助于预防HPV感染和疣体的复发。